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戴维·贝克团队两篇Nature连发:AI设计分子剪刀,改写治病同归于尽的药理逻辑

机制

治病吃药,为什么每次都得一大把一大把地吞?

因为现在的药太笨了,基本全靠同归于尽。 一个药分子抓牢一个坏蛋白,死死卡住对方,自己也废了。 这在医学上叫化学计量结合。 体内要是有十亿个致病蛋白,你就得往血液里灌进去至少十亿个药分子。 为了保证药分子能在复杂的体内环境里撞上目标,药量还得再翻很多倍。 药量灌得越大,肝脏和肾脏的代谢压力就越沉重。

如果药分子不用同归于尽,直接变成一把微型剪刀呢? 它游过去,找准阿尔茨海默病或者渐冻症的致病蛋白,咔嚓剪成两截。 切断一个,立刻松手,接着去切第二个、第三个、第一万个。 一个药分子就能把成千上万个致病蛋白全部报废。 药的有效浓度,瞬间就能降到极低的水平。

这种能反复切碎蛋白质的分子剪刀,学名叫蛋白酶。 原理听起来很痛快,但造出来难于登天。 蛋白质链条上的肽键硬得像钢筋,扔在水里自然水解,动辄需要几百年。 自然界的生物酶花了十几亿年的漫长进化,才把催化中心折叠到亚埃米的精度。 人类科学家以前试着手工设计人工蛋白酶,就像蒙着眼睛拼机械表,稍微偏一点点,剪刀就钝了,根本切不动。

这次把这扇门踹开的,是AI。 2024年刚拿了诺贝尔化学奖的戴维·贝克,带着华盛顿大学蛋白质设计研究所,在《自然》杂志上一口气发表了两篇论文。 他们用AI算法从零设计出了自然界根本不存在的全新蛋白酶。 其中博士后陈安琪和吴柯嘉团队,用金属锌离子充当剪刀的刀刃。 AI生成的新蛋白不仅稳稳包裹住了这个金属离子,而且超过三分之一的设计能精准切断目标。 面对导致阿尔茨海默病的致病蛋白,它的切割速度比没有酶参与的自然状态快了1亿倍。 另一篇论文的第一作者是研究生崔浩宰。 他们用活化的半胱氨酸当刀刃,也做出了19%的成功率,催化速度最高提升了3000万倍。

这就把以往只能“被动占位”的靶点,变成了可以直接“物理粉碎”。 贝克团队现在的研发目标已经排到了渐冻症、疟疾、癌症和细菌毒素。 除了在人体里治病,他们还打算用这种人造剪刀去定点降解塑料垃圾和有毒污染物。

那明天能去药店买到这种分子剪刀吗? 还没那么快,眼前还有两道实打实的工程坎。 第一道坎是人体的免疫排斥。 这些剪刀是AI凭空算出来的全新结构,人体免疫系统从来没见过。 直接打进血管,大概率会被免疫大军当成入侵外敌当场围剿。 崔浩宰他们目前正在攻关的方案,是把剪刀的催化中心藏进人畜无害的人体抗体骨架里,搞一把披着抗体羊皮的剪刀狼。 第二道坎是刹车开关。 催化反应一旦开工就停不下来,必须能随叫随停。 如果不能精准调控开关,切过了头或者误伤了正常蛋白,麻烦同样很大。

从前对付致病蛋白,药理学的逻辑全靠按个头堆兵力,拼的是药量。 现在有了AI从零设计的分子剪刀,给细胞派去的是不知疲倦的微型工兵。 等这把剪刀真正披上伪装、装上刹车走进临床,很多无药可医的绝症,可能真要迎来完全不同的打法了。

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